实际上，对于“印顺长老大乘非佛说思想”的反思由来已久。最早于大陆佛教界形成的讨论高峰期，是在印顺长老仍在大陆、尚未撤台以前。首先对印顺长老提出批评意见的，正是其导师太虚大师本人。虽然印顺长老的革新思想部分受启发于太虚大师，然而后世多认为二人的知见和立场，有着根本性质上的差别。 一直以来，教界和学界均有相当程度的反思，认为处于二十世纪西方思想汹涌东进时代的印顺长老，其思想推演过度倚重西方近代理性主义、人本经验主义和科学主义，忽略了宗教与世俗知识的根本界限。印顺长老的知见立场，有别于传统中国化大乘佛法的根本传承，并未将佛法当作佛陀超越意识所证的诸法实相来看，而是将佛法当作世间以意识心悬想计度的学说看；未能看到佛教史是一味的佛法对于不同根基的众生在不同因缘下的展现，而看到的则是所谓“原始佛法”被后世佛教徒打着佛陀旗号改编、创造的过程。